Всего несколько недель прошло с момента победы над Кэрол, но Хибики [立花 響] вновь вынуждена выходить на передовую. Она держится на грани сил, противостоя самому грозному противнику, которого знало человечество — летнему заданию, которое словно висит над её головой. Однако ей не суждено успеть к началу нового семестра — миру угрожает новая опасность. Цубаса [風鳴 翼] и Мария [マリア・カデンツァヴナ・イブ], занимающиеся расследованием Александрийского инцидента, сталкиваются с Баварскими Иллюминатами — загадочной организацией, за которой кроются тревожные дела, связанные с Кэрол и инцидентом Фронтира. Погнавшись за ними в разорённую войной южноамериканскую республику Валверде, носители «Мехасимфоний» становятся свидетелями мощи, который ранее не встречалась, силы, способной одолеть даже Бога.
