Ра-Зефон

В 2012 году Японию настигло нашествие Мю — гуманоидных существ с голубой кровью, что прибыли из иного измерения. К 2015 году вторжение достигает Токио, но напряжённое противостояние держится благодаря загадочному оружию под названием «долем», способному отражать силу врага. В этом хаосе Аято Камина сталкивается с одноклассницей Рэикой Мисиму. В тот же день власти пытаются поймать юношу, однако на сцену выходит женщина Харука Шито, заявляющая, что её направила организация «TERRA», и сообщает, что Токио запечатан во временном разрыве, где время идёт примерно в одну треть обычной скорости. Чтобы скрыться, Аято прячется и запрыгивает на поезд, снова встречая Рэику. По прибытии в Зал Ра он идёт за ней к гигантскому яйцу, из которого вылупился долем RahXephon. Внезапно на вершине разрыва появляется мать Аято и пытается остановить вторжение «TERRA». Во время боя она получает рану, и, увидев её голубую кровь, Аято вместе с Харокой вынуждены уйти прочь, оставив за спиной таинственную силу RahXephon.