Действие аниме разворачивается вокруг безупречного города, который называют зоной №6. В 2013 году этот мегаполис кажется образцом утончённого благополучия, где каждый шаг тщательно контролируется. Сиону [紫苑] с самого детства присвоили статус обладателя «высокого уровня интеллекта», и за выдающиеся способности ему позволили жить в роскошном квартале Кронос. На его двенадцатый день рождения он знакомится с Нэзуми [ネズミ] — красивым молодым человеком, который сбежал из исправительной колонии. Прикрывая беглеца, Сиону согласно решению Бюро общественной безопасности лишается всех привилегий и вылетает из Кроноса в так называемый Потерянный город. Четыре года спустя таинственное происшествие толкает Сиона к разгадке и приводит его к скрытой правде о шестой зоне, открывая перед ним мир, полный загадок и неясностей, лежащих за идеальностью города.
